Stworzenie sekcji piłkarskiej kobiet było jednym z ważniejszych punktów w „Planie rozwoju 2020-23”. Latem 2020 roku doszło do połączenia sił „Zielonych” i Lejdis Luboń – w ten sposób powstały w lipcu tego roku grupy szkoleniowe w Akademii Warty Poznań, a ponadto drużyna została zgłoszona do rozgrywek IV ligi.

W ten sposób Warta Poznań wróciła do żeńskiej ligi po 18 latach. Sekcja kobiet powstała w 2000 roku, a Warta jako pierwszy poznański klub przystąpiła wówczas do rozgrywek ligowych. Swoje mecze rozgrywała na stadionie przy Drodze Dębińskiej. W pierwszym sezonie zespół awansowała do I ligi, a w 2002 roku odniósł swój największy sukces, gdy pod szyldem Atena Poznań (zmiana nazwy nastąpiła w trakcie sezonu) sięgnął po brązowe medale mistrzostw Polski.